Es hijo del célebre actor argentino Héctor Alterio y hermano de la actriz Malena Alterio
Dado el activismo político izquierdista de su padre, su familia abandonó Argentina tras el Golpe de Estado en 1976
Inició en España sus estudios de biología, pero los dejó para estudiar Historia, carrera en la que solo duró dos años, negando su vocación artística
Finalmente, estudió Arte Dramático con Cristina Rota y Daniel Sánchez
Fundó el grupo teatral Ración de Oreja, compañía con la que representó la obra teatral "Animalario" en 1996
Tras participar en bastantes proyectos teatrales de contenido político, se empezó a relacionar el nombre de Ernesto con el movimiento progresista y de izquierdas de la farándula de España
Comenzó su carrera cinematográfica con pequeñas participaciones en cintas como "Mi nombre es sombra", "Tengo una casa" o "Morirás en Chafarinas"
Alcanzó su mayor éxito protagonizando la comedia musical "El otro lado de la cama", en la cual demostró sus dotes para el baile, y la cual le valió una candidatura a los premios de la Unión de Actores
En televisión ha trabajado en series como "Los ladrones van a la oficina", "Todos los hombres sois iguales" o "La chica de ayer", entre otras
Ha trabajado con su padre en varias películas como "Semen", "una historia de amor", "Entre nosotros" (en la que también participó su hermana Malena) y la serie de televisión "Vientos de agua"
Es un actor polifacético; además de cine y televisión, también ha hecho teatro: "Animalario", "El fin de los sueños" o "Edipo rey" son algunas de las obras en las que ha actuado
Le gusta practicar el bikram yoga
Ha trabajado en los largometrajes "¿Quién mató a Bambi?", "Incidencias" o "Perfectos desconocidos", así como en las series "Las chicas del cable" o "Narcos: México"